Die Abteilung Gynäkologie wird sowohl als Belegabteilung wie einer Praxis in Clausthal-Zellerfeld geführt. Das ermöglicht eine enge Verzahnung von ambulanter und stationärer Behandlung einschließlich der praeoperativen Vorbereitung und der postoperativen Nachsorge.
Die Abteilung behandelt überwiegend Indikationen der gynäkologischen Grundversorgung und führt kleinere Eingriffe im Robert-Koch-Krankenhaus durch. Zwei Belegbetten stehen für die stationäre Versorgung der Patientinnen bereit.